生体分子の中で繰り広げられる量子現象を理解するためには、その現象を構成する分子の物性を知る必要があります。原子が規則的に並んだ物質を対象とするいわゆる固体物理の分野では、抵抗率、磁化率や比熱などを指標として温度や圧力などの物理量を変化させることで相図が得られます。この相図をもとに超伝導や磁気特性などを理解し、相転移などのメカニズムを知ることで、物理現象を明らかにしてきました。その研究の一端を担ってきたのが、放射光施設で得られる特殊な光の利用です。最近の光学技術、真空技術や検出技術の発展により、生体分子を対象とした分光測定も行えるようになりました。さらに計算機技術の進歩により、得られた実験結果をシミュレーションを用いて追随することもできるようになりました。我々のチームでは、放射光施設(NanoTerasu)における分光測定を駆使して、生体内における物理現象を理解することを目指しています。
チームリーダー 藤井 健太郎
メンバー
藤井 健太郎 チームリーダー
野口 実穂 主幹研究員
Ugalino Ralph 博士研究員
2024年度の成果
- Y. Izumi*, R. Ugalino*, J. Miyawaki, C. Shibazaki, M. Adachi, N. Kurahashi, H. Kiuchi, Y. Harada, K. Fujii, Electronic structures of blue copper centers of amicyanin and azurin and solution state, Dalton Transactions 54 1980-1985 (2025) *: equal contribution
- K. Fujii, Y. Izumi, N. Maita, M. Koichi M. Kato, Observation of the liquid-liquid phase separation of FUS-LC using vacuum-ultraviolet circular dichroism spectroscopy, Chrality, 36 e23707 (2024)
- M-A Herve du Penhoat, A. Souchaud, A. Rajpal, R. Vuilleumier, M-P Gaigeot, I. Tavernelli, K. Fujii, A. Yokoya, S-DTendero, M-F Politis, Ultrafast Fragmentation of Highly-excited Doubly-ionized Deoxyribose: Role of the Liquid, Water Environment, PCCP 26 15693-15704 (2024).
- S. Nakagawa, T. Maeyama, A. Yokoya, M. Ohara, N. Usami, Distribution of the dose response in a silicone-based radio-fluorogenic dosimeter and FWT-60 irradiated with monochromatic low-energy X-rays, Radiation Measurements, 181 107347 (2025).
- W. Zhang, M. al Samarai, H. Zhao, D. Liu, H. Kiuchi, R. Ugalino, S. Li, F. Yao, Q. Feng, Y. Harada, Facet-dependent photocatalytic performance and electronic structure of single-crystalline anatase TiO2 particles revealed by X-ray photoelectron spectromicroscopy, Journal of Materials Chemistry C, 13 61-37 (2024).
- 廣瀬エリ、横谷明徳、野口実穂、Lucie Huart、鈴木啓司, ゲノムの構造と機能、およびエネルギー代謝に及ぼす放射線の長期影響, 放射線生物研究 59 134-156 (2024).
2023年度の成果
- K. Nishikubo, M. Hasegawa, Y. Izumi, K. Fujii , K. Matsuo, Y. Matsumoto, A. Yokoya, Structural study of wild-type and phospho-mimic XRCC4 dimer and multimer proteins using circular dichroism spectroscopy, Int. J. Radiat. Biol. 91684-1691 (2023).
- M. Hirato, A. Yokoya, Y. Baba, S. Mori, K. Fujii, S. Wada, Y. Izumi, Incorporation of a bromine atom into DNA-related molecules changes their electronic properties, PCCP, 21 14836-14847 (2023).
- Y. Izumi, M. Ohara, K. Fujii, A. Yokoya, M. Ogawa, X-ray irradiation-induced ligand cleavage of a phthalocyanine derivative, tin (IV) phthalocyanine dichloride: A potential for X-ray activation of caged compounds, Chem. Phys. Lett. 822 140508 (2023).
2022年度の成果
- Y. Izumi, K. Matsuo, A. Yokoya, Secondary structural analyses of histone H2A-H2B proteins extracted from heated cells, Chirality 35・3 165-171 (2022).
- H. Yu, Y. Kondo, K. Fujii, A. Yokoya, S. Yamashita, Establishment of a Method for Investigating Direct and Indirect Actions of Ionizing Radiation Using Scavenger-free Plasmid DNA, Radiat. Res. 197・6 594-604 (2022).
- K. Horiba, T. Imazono, H. Iwasawa, K. Fujii, J. Miyawaki, Y. Ohtsubo, N. Inami, T. Nakatani, K. Inaba, A. Agui, H. Kimura, M. Takahashi, Design of nano-ARPES beamline at 3-GeV next-generation synchrotron radiation facility, NanoTerasu Journal of Physics: Conference Series. 2380 12034 (2022).
- Y. Ohtsubo, T. Ueno, H. Iwasawa, J. Miyawaki, K. Horiba, A. Agui, K. Inaba, T. Nakatani, T. Imazono, K. Fujii, H. Kimura, M. Takahashi, Design for nano-spintronics beamline at 3-GeV next-generation synchrotron radiation facility, NanoTerasu Journal of Physics: Conference Series. 2380 12037 (2022).
- J. Miyawaki, K. Fujii, T. Imazono, K. Horiba, Y. Ohtsubo, N. Inami, T. Nakatani, K. Inaba, A. Agui, H. Kimura, M. Takahasi, Design of Ultrahigh Energy Resolution RIXS Beamline at NanoTerasu, Journal of Physics: Conference Series. 2380 (2022).